[ Pakiet źródłowy: mafft ]
Pakiet: mafft (7.505-1)
Odnośniki dla mafft
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego mafft:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [mafft.cbrc.jp]
Podobne pakiety:
Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:
* L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating local pairwise alignment information), * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating global pairwise alignment information), * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions; recommended for <200 sequences),and five speed-oriented methods:
* FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only), * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations), * FFT-NS-2 (fast; progressive method), * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive method with a rough guide tree), * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive method with the PartTree algorithm).
Inne pakiety związane z mafft
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
-
- rec: blast2
- Pakiet niedostępny
-
- rec: libwww-perl
- Prosty i spójny interfejs do WWW
-
- rec: lynx
- Klasyczna przeglądarka internetowa pracująca w trybie tekstowym (nie graficzna)
-
- rec: ruby
- Interpreter zorientowanego obiektowo skryptowego języka Ruby (wersja domyślna)
-
- enh: t-coffee
- Wielosekwencyjne wyrównanie
Pobieranie mafft
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
arm64 | 911,0 KiB | 12 026,0 KiB | [lista plików] |