Pakiet: bwa (0.7.17-7 i inne)
Odnośniki dla bwa
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego bwa:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Carlos Borroto (Strona QA)
- Ognyan Kulev (Strona QA)
- Michael R. Crusoe (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [bio-bwa.sourceforge.net]
Podobne pakiety:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Inne pakiety związane z bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- rec: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
-
- sug: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
Pobieranie bwa
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
arm64 | 0.7.17-7+b4 | 193,0 KiB | 448,0 KiB | [lista plików] |