Pakiet: concavity (0.1+dfsg.1-5) [debports]
Odnośniki dla concavity
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [compbio.cs.princeton.edu]
Podobne pakiety:
predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation
ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.
ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.
The following result files are produced by default:
* Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores). * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb). * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx). * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).
Inne pakiety związane z concavity
|
|
|
|
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- sug: conservation-code
- protein sequence conservation scoring tool
-
- sug: pymol
- Molekularny system graficzny
Pobieranie concavity
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 237,3 KiB | 1 051,0 KiB | [lista plików] |