Pakiet: swarm (2.2.2+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: swarm-cluster  ]

robust and fast clustering method for amplicon-based studies

The purpose of swarm is to provide a novel clustering algorithm to handle large sets of amplicons. Traditional clustering algorithms results are strongly input-order dependent, and rely on an arbitrary global clustering threshold. swarm results are resilient to input-order changes and rely on a small local linking threshold d, the maximum number of differences between two amplicons. swarm forms stable high-resolution clusters, with a high yield of biological information.

Inne pakiety związane z swarm

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• rec: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

Pobieranie swarm

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	610,3 KiB	742,0 KiB	[lista plików]