Pakiet: infernal (1.1.2-2)

[ Pakiet źródłowy: infernal  ]

Wyrównywanie drugorzędowej struktury RNA

Infernal ("INFERence of RNA ALignment") przeszukuje bazę danych w celu znalezienia sekwencji DNA (i sekwencji podobnych) w strukturze RNA. Dostarcza implementację szczególnego wariantu profilu stochastycznych gramatyk bezkontekstowych zwanych modelami kowariancji (CMs). CM (model kowariancji) przypomina profil sekwencji, za wyjątkiem zgodności wyniku kombinacji sekwencji i struktur drugorzędowych RNA. Z tego powodu, w wielu przypadkach, znacznie łatwiej jest zidentyfikować homologi RNA, które zachowują swoją drugorzędową strukturę, niż ich pierwotną sekwencję.

Narzędzie jest integralną częścią bazy danych Rfam.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z infernal

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

Pobieranie infernal

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	21 623,7 KiB	41 439,0 KiB	[lista plików]
i386	19 435,4 KiB	41 274,0 KiB	[lista plików]