Pakiet: melting (5.2.0-1)

[ Pakiet źródłowy: melting  ]

compute the melting temperature of nucleic acid duplex

This program computes, for a nucleic acid duplex, the enthalpy, the entropy and the melting temperature of the helix-coil transitions. Three types of hybridisation are possible: DNA/DNA, DNA/RNA, and RNA/RNA. The program first computes the hybridisation enthalpy and entropy from the elementary parameters of each Crick's pair by the nearest-neighbor method. Then the melting temperature is computed. The set of thermodynamic parameters can be easily changed, for instance following an experimental breakthrough.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, field::biology:molecular, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, scope::utility, Zestaw oprogramowania: GNU, Przeznaczenie: use::analysing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z melting

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

  lub java-runtime

  pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre

• dep: java-wrappers

  Nakładki na pliki wykonywalne Javy

• sug: melting-gui

  Pakiet niedostępny

Pobieranie melting

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	3 586,9 KiB	5 300,0 KiB	[lista plików]