Pakiet: fastx-toolkit (0.0.14-6)

[ Pakiet źródłowy: fastx-toolkit  ]

FASTQ/A short nucleotide reads pre-processing tools

The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for preprocessing short nucleotide reads in FASTA and FASTQ formats, usually produced by Next-Generation sequencing machines. The main processing of such FASTA/FASTQ files is mapping (aligning) the sequences to reference genomes or other databases using specialized programs like BWA, Bowtie and many others. However, it is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files before mapping the sequences to the genome—manipulating the sequences to produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these preprocessing tasks.

Znaczniki: Rola: Program

Inne pakiety związane z fastx-toolkit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgd-graph-perl

  Graph Plotting Module for Perl 5

• dep: libgtextutils0v5

  Gordon Text_utils library

• dep: libperlio-gzip-perl

  module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie fastx-toolkit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	109,8 KiB	615,0 KiB	[lista plików]
arm64	108,0 KiB	553,0 KiB	[lista plików]
armhf	104,6 KiB	468,0 KiB	[lista plików]
i386	111,7 KiB	604,0 KiB	[lista plików]