Pakiet: exonerate (2.4.0-4)
Odnośniki dla exonerate
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego exonerate:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Steffen Moeller (Strona QA)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [www.ebi.ac.uk]
Podobne pakiety:
generic tool for pairwise sequence comparison
Exonerate allows you to align sequences using a many alignment models, using either exhaustive dynamic programming, or a variety of heuristics. Much of the functionality of the Wise dynamic programming suite was reimplemented in C for better efficiency. Exonerate is an intrinsic component of the building of the Ensembl genome databases, providing similarity scores between RNA and DNA sequences and thus determining splice variants and coding sequences in general.
An In-silico PCR Experiment Simulation System (see the ipcress man page) is packaged with exonerate.
This package also comes with a selection of utilities for performing simple manipulations quickly on fasta files beyond 2Gb
Inne pakiety związane z exonerate
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
-
- dep: libglib2.0-0 (>= 2.24.0)
- Glib, biblioteka funkcji języka C
-
- sug: wise
- comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences
-
- enh: bioperl-run
- Nakładki na BioPerl: skrypty
Pobieranie exonerate
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
amd64 | 1 507,6 KiB | 8 281,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 1 382,0 KiB | 8 053,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 1 355,8 KiB | 5 572,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 1 644,4 KiB | 8 892,0 KiB | [lista plików] |