Pakiet: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Inne pakiety związane z sprai

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: time

  Program GNU time do pomiaru wykorzystania zasobów procesora

• sug: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• sug: pbalign

  map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

• sug: pbgenomicconsensus

  Pacific Biosciences variant and consensus caller

• sug: pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

Pobieranie sprai

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	1 477,5 KiB	1 699,0 KiB	[lista plików]