Pakiet: r-bioc-bitseq (1.26.1+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-bitseq  ]

transcript expression inference and analysis for RNA-seq data

The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.

Inne pakiety związane z r-bioc-bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: r-api-3.5

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie r-bioc-bitseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	933,3 KiB	5 552,0 KiB	[lista plików]