Pakiet: python-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Pakiet źródłowy: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 2)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 2.

Inne pakiety związane z python-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja GnuTLS)

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  Biblioteka do kompresji w formacie XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Zestaw narzędzi Secure Sockets Layer - biblioteki współdzielone

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python

• dep: python-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python-numpy

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: python-cyvcf2-doc

  Pakiet niedostępny

Pobieranie python-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	734,6 KiB	4 524,0 KiB	[lista plików]