Pakiet: ltrsift (1.0.2-8)

[ Pakiet źródłowy: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zakres: Narzędzie, Pakiet narzędziowy interfejsu: GTK, Przeznaczenie: use::analysing, use::browsing, Porównywanie, Organizowanie danych, use::viewing, x11::application

Inne pakiety związane z ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  ATK, zestaw narzędzi dostarczający interfejsy dostępu

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  Ogólna bilioteka konfiuracji czcionek - uruchomieniowa

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Silnik czcionek FreeType 2, pliki biblioteki współdzielonej

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  Biblioteka GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  Glib, biblioteka funkcji języka C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  Biblioteka graficznego interfejsu użytkownika GTK+

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• rec: last-align

  Porównywanie sekwencji biologicznych w skali genomu

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Pobieranie ltrsift

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	90,1 KiB	340,0 KiB	[lista plików]