Pakiet: blixem (4.44.1+dfsg-3)

[ Pakiet źródłowy: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: GTK

Inne pakiety związane z blixem

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  ATK, zestaw narzędzi dostarczający interfejsy dostępu

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2)

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  Ogólna bilioteka konfiuracji czcionek - uruchomieniowa

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Silnik czcionek FreeType 2, pliki biblioteki współdzielonej

• dep: libgbtools0

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  Biblioteka GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  Glib, biblioteka funkcji języka C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0)

  Biblioteka graficznego interfejsu użytkownika GTK+

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie blixem

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	314,0 KiB	1 115,0 KiB	[lista plików]