wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: murasaki  ]

Pakiet: murasaki-mpi (1.68.6-8 i inne)

Odnośniki dla murasaki-mpi

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Inne pakiety związane z murasaki-mpi

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie murasaki-mpi

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 1.68.6-8+b1 614,8 KiB4 026,0 KiB [lista plików]