Pakiet: macs (2.1.2.1-1)

[ Pakiet źródłowy: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Inne pakiety związane z macs

• dep: cython

  C-Extensions for Python

• dep: libc6 (>= 2.22)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy

  Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python

Pobieranie macs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 397,2 KiB	5 551,0 KiB	[lista plików]