Pakiet: kalign (1:2.03+20110620-5)

[ Pakiet źródłowy: kalign  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	90,7 KiB	253,0 KiB	[lista plików]