Pakiet: fastqtl (2.184+dfsg-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z fastqtl

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.67.0

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.25)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgsl23 (>= 2.5)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts2 (>= 1.0)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: r-mathlib

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Pobieranie fastqtl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.184+dfsg-6+b1	191,2 KiB	657,0 KiB	[lista plików]