Pakiet: altree (1.3.1-10 i inne)

[ Pakiet źródłowy: altree  ]

Program do wykonywania analiz dotyczących związku i miejsca na podstawie filogenezy

ALTree został zaprojektowany do wykrywania związku oraz wyszukiwania miejsc podatnych na zakażenie przy użyciu drzew filogenetycznych haplotypu: po pierwsze, umożliwia wykrycie związku pomiędzy genem kandydującym a chorobą, i po drugie, pozwala na postawienie hipotezy na temat podatności loci.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Perl, Biblioteki, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Rola: Biblioteka deweloperska, role::program, role::shared-lib, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, works-with-format::TODO, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z altree

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libmath-tamuanova-perl

  Perl extension for the tamuanova library

• dep: perl (>= 5.32.0-4)

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: perlapi-5.32.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• rec: libopenblas-base

  Optimized BLAS (linear algebra) library (transitional)

  lub libatlas3-base

  Automatically Tuned Linear Algebra Software, generic shared

  lub libmkl-rt

  Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• sug: altree-examples

  Przykładowe pliki do ALTree

Pobieranie altree

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
s390x	1.3.1-10+b1	327,7 KiB	556,0 KiB	[lista plików]