Pakiet: zalign (0.9.1-5)

[ Pakiet źródłowy: zalign  ]

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Inne pakiety związane z zalign

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie zalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	50,7 KiB	415,0 KiB	[lista plików]