Pakiet: grabix (0.1.7-2)
Odnośniki dla grabix
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego grabix:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
wee tool for random access into BGZF files
In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.
grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.
Inne pakiety związane z grabix
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: tabix
- Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
Pobieranie grabix
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
ppc64el | 14,9 KiB | 92,0 KiB | [lista plików] |