wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: plasmidseeker  ]

Pakiet: plasmidseeker (1.3+dfsg-1)

Odnośniki dla plasmidseeker

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego plasmidseeker:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads

PlasmidSeeker is a k-mer based program for the identification of known plasmids from bacterial whole genome sequencing reads.

PlasmidSeeker that enables the detection of plasmids from bacterial WGS data without read assembly. The PlasmidSeeker algorithm is based on k-mers and uses k-mer abundance to distinguish between plasmid and bacterial sequences. The performance of PlasmidSeeker was tested on a set of simulated and real bacterial WGS samples, resulting in 100% sensitivity and 99.98% specificity.

Inne pakiety związane z plasmidseeker

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie plasmidseeker

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
arm64 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
armel 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
armhf 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
i386 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
mips64el 26,5 KiB94,0 KiB [lista plików]
mipsel 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
ppc64el 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]
s390x 26,4 KiB94,0 KiB [lista plików]