Pakiet: python3-pairtools (0.3.0-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: pairtools  ]

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Inne pakiety związane z python3-pairtools

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-nose

  test discovery and running for Python3 unittest

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

Pobieranie python3-pairtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mipsel	0.3.0-2+b2	108,0 KiB	414,0 KiB	[lista plików]