[ Pakiet źródłowy: sumaclust ]
Pakiet: sumaclust (1.0.36+ds-1)
Odnośniki dla sumaclust
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego sumaclust:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Tim Booth (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Pierre Gruet (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [metabarcoding.org]
Podobne pakiety:
fast and exact clustering of genomic sequences
With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.
Inne pakiety związane z sumaclust
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libsuma1 (>= 1.0.35)
- shared library for sumatra and sumaclust
Pobieranie sumaclust
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| i386 | 100,7 KiB | 162,0 KiB | [lista plików] |