wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: t-coffee  ]

Pakiet: t-coffee (13.41.0.28bdc39+dfsg-4)

Odnośniki dla t-coffee

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego t-coffee:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Wielosekwencyjne wyrównanie

T-Coffee jest pakietem do wielosekwencyjnego wyrównania. Generuje wiele sekwencji wyrównania z zestawu sekwencji białka lub DNA.

T-Coffee pozwala na kombinację zbiorów złożonych z wielu par, globalne lub lokalne wyrównania w pojedynczym modelu. Umożliwia także oszacowywanie poziomu spójności każdej pozycji w nowym wyrównaniu z resztą wyrównań. Aby uzyskać więcej informacji, należy zapoznać się z przedrukami dokumentacji.

T-Coffee zawiera specjalny dodatek o nazwie M-Coffee, który umożliwia połączenie danych wyjściowych z wielu pakietów wielosekwencyjnych wyrównań. W opublikowanej wersji używa: MUSCLE, PROBCONS, POA, DiAlign-TS, MAFFT, Clustal W, PCMA i T-Coffee. Specjalna wersja stworzona do Debiana, DM-Coffee, korzysta tylko z wolnego oprogramowania, zastępując Clustal W przez Kalign. Korzystanie z tych 8 metod z M-Coffee może być nieco trudne. Można również używać ulubionego podzbioru metod.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Obsługa formatu: Wymaga dodatkowego znacznika, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Inne pakiety związane z t-coffee

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie t-coffee

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
armel 829,9 KiB2 504,0 KiB [lista plików]