Pakiet: libmems1 (1.6.0+4725-9 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libmems  ]

library to support DNA string matching and comparative genomics

libMems is a freely available software development library to support DNA string matching and comparative genomics. Among other things, libMems implements an algorithm to perform approximate multi-MUM and multi-MEM identification. The algorithm uses spaced seed patterns in conjunction with a seed-and-extend style hashing method to identify matches. The method is efficient, requiring a maximum of only 16 bytes per base of the largest input sequence, and this data can be stored externally (i.e. on disk) to further reduce memory requirements.

This package contains the dynamic library.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libmems1

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgenome0 (>= 1.3.11+svn20110227.4616)

  toolkit for developing bioinformatic related software

• dep: libmuscle1 (>= 3.7+4565)

  multiple alignment library for protein sequences

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie libmems1

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	1.6.0+4725-9+b1	613,9 KiB	1 832,0 KiB	[lista plików]