Pakiet: r-bioc-biocneighbors (1.16.0+ds-1)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-biocneighbors  ]

Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages

Implements exact and approximate methods for nearest neighbor detection, in a framework that allows them to be easily switched within Bioconductor packages or workflows. Exact searches can be performed using the k-means for k-nearest neighbors algorithm or with vantage point trees. Approximate searches can be performed using the Annoy or HNSW libraries. Searching on either Euclidean or Manhattan distances is supported. Parallelization is achieved for all methods by using BiocParallel. Functions are also provided to search for all neighbors within a given distance.

Inne pakiety związane z r-bioc-biocneighbors

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpphnsw

  R bindings for a Library for Approximate Nearest Neighbors

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-fnn

  GNU R fast nearest neighbor search algorithms and applications

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcppannoy

  Rcpp bindings for Annoy (approximate nearest neighbors)

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Pobieranie r-bioc-biocneighbors

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	568,2 KiB	1 424,0 KiB	[lista plików]
arm64	537,6 KiB	1 376,0 KiB	[lista plików]
armel	538,9 KiB	1 374,0 KiB	[lista plików]
armhf	539,9 KiB	1 246,0 KiB	[lista plików]
i386	538,5 KiB	1 457,0 KiB	[lista plików]
mips64el	521,7 KiB	1 627,0 KiB	[lista plików]
mipsel	521,1 KiB	1 586,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	556,9 KiB	1 632,0 KiB	[lista plików]
s390x	554,4 KiB	1 456,0 KiB	[lista plików]