Pakiet: pbbamtools (2.1.0+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: pbbam  ]

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Inne pakiety związane z pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpbbam2.1.0 (= 2.1.0+dfsg-2)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.0.0 (>= 2.0.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• rec: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie pbbamtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	122,3 KiB	683,0 KiB	[lista plików]