Pakiet: mmseqs2 (14-7e284+ds-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: mmseqs2  ]

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Inne pakiety związane z mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [nie ppc64el]

  Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie mmseqs2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	14-7e284+ds-1+b2	23 191,5 KiB	68 422,0 KiB	[lista plików]
arm64	14-7e284+ds-1+b2	6 879,9 KiB	15 487,0 KiB	[lista plików]
mips64el	14-7e284+ds-1+b2	6 858,7 KiB	16 543,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	14-7e284+ds-1+b2	7 119,7 KiB	16 831,0 KiB	[lista plików]