Pakiet: abyss (2.3.5+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: abyss  ]

Nowy, równoległy, sekwencyjny asembler do krótkich odczytów

ABySS jest nowym, równoległym asemblerem sekwencji, przeznaczonym do krótkich odczytów. Może być używany do złożenia danych genomu lub transkryptomeksji. Równoległość osiągana jest za pomocą: MPI, OpenMP i pthread.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

Pobieranie abyss

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mips64el	3 024,1 KiB	12 629,0 KiB	[lista plików]