Pakiet: python3-pyfaidx (0.7.1-2)

[ Pakiet źródłowy: python-pyfaidx  ]

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

Inne pakiety związane z python3-pyfaidx

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-pkg-resources

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

• dep: python3-six

  Python 2 and 3 compatibility library

• rec: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

Pobieranie python3-pyfaidx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	27,4 KiB	121,0 KiB	[lista plików]