Pakiet: r-bioc-dnacopy (1.72.3-1)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-dnacopy  ]

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Inne pakiety związane z r-bioc-dnacopy

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Pobieranie r-bioc-dnacopy

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	368,8 KiB	516,0 KiB	[lista plików]