Pakiet: porechop (0.2.4+dfsg-4)

[ Pakiet źródłowy: porechop  ]

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Inne pakiety związane z porechop

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Pobieranie porechop

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	54,8 KiB	229,0 KiB	[lista plików]