Pakiet: libhts3 (1.16+ds-3)

[ Pakiet źródłowy: htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libhts3

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja GnuTLS)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Szybka kompresja i dekompresja oparta na całym buforze DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Biblioteka do kompresji w formacie XZ

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  Zestaw narzędzi Secure Sockets Layer - biblioteki współdzielone

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie libhts3

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	458,0 KiB	1 151,0 KiB	[lista plików]