Pakiet: artemis (18.2.0+dfsg-3)

[ Pakiet źródłowy: artemis  ]

Program do przeglądania genomów i tworzenia adnotacji

Artemis to przeglądarka genomów i narzędzie do adnotacji, które umożliwia wizualizację cech sekwencji, danych nowej generacji i wyników analiz w kontekście tej sekwencji, a także jej translację w sześciu ramkach.

Pakiet zawiera program do przeglądania genomów Artemis, Artemis Comparison Tool (ACT) oraz narzędzia DNAplotter i BamView.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::java, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, use::editing, Działa z: Sekwencje biologiczne, X Window System: Aplikacja

Inne pakiety związane z artemis

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: jemboss

  graphical user interface to EMBOSS

• dep: libbatik-java (>= 1.16)

  xml.apache.org SVG Library

• dep: libbiojava-java (>= 1:1.9.5+dfsg)

  Java API to biological data and applications (default version)

• dep: libcglib-java (>= 3.3.0)

  Code generation library for Java

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang utility classes

• dep: libcommons-logging-java (>= 1.2)

  common wrapper interface for several logging APIs

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libibatis-java (>= 2.3.4.726)

  iBATIS Data Mapper framework

• dep: libj2ssh-java (>= 0.2.9)

  Java library for the SSH protocol

• dep: liblog4j1.2-java

  Logging library for java

• dep: libpicard-java

  Java library to manipulate SAM and BAM files

• dep: libpostgresql-jdbc-java

  Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

Pobieranie artemis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	3 710,6 KiB	20 783,0 KiB	[lista plików]