[ Bron: bowtie ]
Pakket: bowtie-examples (1.3.0+dfsg1-1)
Verwijzigingen voor bowtie-examples
Debian bronnen:
Het bronpakket bowtie downloaden:
Beheerders:
- Debian Med Packaging Team (QA-pagina, Mailarchief)
- Steffen Moeller (QA-pagina)
- Andreas Tille (QA-pagina)
- Ognyan Kulev (QA-pagina)
- Stephan Struckmann (QA-pagina)
- Alexandre Mestiashvili (QA-pagina)
Externe bronnen:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Vergelijkbare pakketten:
Voorbeelden voor bowtie, de ultrasnelle, geheugenzuinige short-read aligner
Dit pakket helpt bij de problemen die ontstaan bij het interpreteren van de laatste (2010) sequencing-technieken. Deze geven alleen korte sequenties, die niet direct geïnterpreteerd worden. De uitdaging voor programma's zoals Bowtie is om voor elke run de chomosomale locatie van de gegeven DNA-sequentie te vinden
Bowtie aligns korte DNA-sequenties (reads) van het menselijke genoom met een snelheid boven de 25 miljoen 35-bp reads per uur. Bowtie indexeert het genoom met een Burrows-Wheeler index om het geheugengebruik laat te houden: meestal zo'n 2.2 GB voor het menselijke genoom (2.9 GB voor paired-end).
Dit pakket bevat wat extra voorbeelddata voor bowtie.