すべてのオプション
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ ソース: t-coffee  ]

パッケージ: t-coffee (13.45.0.4846264+really13.41.0.28bdc39+dfsg-1)

t-coffee に関するリンク

Screenshot

Debian の資源:

t-coffee ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

類似のパッケージ:

Multiple Sequence Alignment

T-Coffee is a multiple sequence alignment package. Given a set of sequences (Proteins or DNA), T-Coffee generates a multiple sequence alignment. Version 2.00 and higher can mix sequences and structures.

T-Coffee allows the combination of a collection of multiple/pairwise, global or local alignments into a single model. It can also estimate the level of consistency of each position within the new alignment with the rest of the alignments. See the pre-print for more information

T-Coffee has a special called M-Coffee that makes it possible to combine the output of many multiple sequence alignment packages. In its published version, it uses MUSCLE, PROBCONS, POA, DiAlign-TS, MAFFT, Clustal W, PCMA and T-Coffee. A special version has been made for Debian, DM-Coffee, that uses only free software by replacing Clustal W by Kalign. Using the 8 Methods of M-Coffee can sometimes be a bit heavy. You can use a subset of your favorite methods if you prefer.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, use::comparing, サポート形式: 追加のタグが必要, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

その他の t-coffee 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

t-coffee のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
ppc64el 1,063.4 kB3,402.0 kB [ファイル一覧]