パッケージ: ont-fast5-api (4.1.1+dfsg-4 など)

[ ソース: ont-fast5-api  ]

simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format

Ont_fast5_api is a simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format.

It provides:

 * Concrete implementation of the fast5 file schema using the generic h5py
   library
 * Plain-english-named methods to interact with and reflect the fast5 file
   schema
 * Tools to convert between multi_read and single_read formats
 * Tools to compress/decompress raw data in files

その他の ont-fast5-api 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, mips64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libvbz-hdf-plugin-dev

  VBZ compression plugin for nanopore signal data (devel)

• dep: libzstd1 (>= 1.5.5)

  高速なロスレス圧縮アルゴリズム

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-h5py (>= 2.10)

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-progressbar

  text progress bar library for Python (Python 3)

ont-fast5-api のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	4.1.1+dfsg-4+b1	50.3 kB	317.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.1.1+dfsg-4+b1	47.9 kB	349.0 kB	[ファイル一覧]
armel	4.1.1+dfsg-4+b1	46.5 kB	267.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.1.1+dfsg-4+b1	47.0 kB	259.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.1.1+dfsg-4+b2	48.8 kB	275.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.1.1+dfsg-4+b1	48.2 kB	353.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.1.1+dfsg-4+b1	49.7 kB	349.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.1.1+dfsg-4+b1	48.9 kB	269.0 kB	[ファイル一覧]