パッケージ: altree (1.3.2-2 など)

[ ソース: altree  ]

program to perform phylogeny-based association and localization analysis

ALTree was designed to perform association detection and localization of susceptibility sites using haplotype phylogenetic trees: first, it allows the detection of an association between a candidate gene and a disease, and second, it enables to make hypothesis about the susceptibility loci.

タグ: ソフトウェア開発: Perl での開発, ライブラリ, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: C, implemented-in::perl, interface::commandline, 役割: 開発ライブラリ, role::program, role::shared-lib, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: 解析, use::comparing, works-with-format::TODO, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の altree 関連パッケージ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libmath-tamuanova-perl

  Perl extension for the tamuanova library

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

• dep: perlapi-5.40.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: perl-base

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  または libblis4

  BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

  または libmkl-rt

  Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• sug: altree-examples

  example files for ALTree

altree のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
mips64el	1.3.2-2+b4	337.6 kB	573.0 kB	[ファイル一覧]