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パッケージ: kma (1.4.15-1)

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mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

その他の kma 関連パッケージ

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arm64 202.4 kB732.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 211.9 kB824.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 228.4 kB796.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 231.2 kB504.0 kB [ファイル一覧]
s390x 236.3 kB684.0 kB [ファイル一覧]