パッケージ: blasr (5.3.5+dfsg-7 など)

[ ソース: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

その他の blasr 関連パッケージ

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.4.3)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-9~)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

blasr のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	5.3.5+dfsg-7+b1	232.8 kB	700.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	5.3.5+dfsg-7+b1	201.7 kB	680.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	5.3.5+dfsg-7+b1	214.9 kB	824.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kB	808.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kB	532.0 kB	[ファイル一覧]