[ ソース: unifrac-tools ]
パッケージ: unifrac-tools (1.4-3 など)
unifrac-tools に関するリンク
Debian の資源:
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)
The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.
This package contains target binaries ssu and faithpd
その他の unifrac-tools 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
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- dep: libgcc-s1 (>= 11)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: liblapacke (>= 3.12.0)
- Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
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- dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)
- 高速な LZ 圧縮アルゴリズムライブラリ - ランタイム
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- dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ
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- dep: libssu0
- high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libsz2 (>= 1.1.3)
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム