ソースパッケージ: cnvkit (0.9.12-1)
cnvkit に関するリンク
Debian の資源:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Michael R. Crusoe (QA ページ)
- Steffen Moeller (QA ページ)
- Olivier Sallou (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [cnvkit.readthedocs.org]
以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。
- cnvkit
- Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
その他の cnvkit 関連パッケージ
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- adep: debhelper-compat (= 13)
- パッケージは利用できません
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- adep: dh-sequence-python3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: dh-python
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- adep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
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- adep: python3-setuptools
- Python3 用配布用ユーティリティへの機能強化
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- adep: pybuild-plugin-pyproject
- Debian helper tools for packaging Python libraries using PEP517
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- adep: python3-pytest
- Simple, powerful testing in Python3
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- adep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
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- adep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- adep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
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- adep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
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- adep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- adep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
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- adep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab
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- adep: python3-pomegranate (>= 0.15)
- Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
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- adep: r-bioc-dnacopy
- R package: DNA copy number data analysis
-
- adep: poppler-utils
- PDF 向けユーティリティ (Poppler ベース)
Download cnvkit
| ファイル | サイズ (単位: kB) | MD5 チェックサム |
|---|---|---|
| cnvkit_0.9.12-1.dsc | 2.4 kB | e27d1f1e38a4734d60298e2acc49383c |
| cnvkit_0.9.12.orig.tar.gz | 31,364.4 kB | 93b29a400a20011da1cf159619d4fe75 |
| cnvkit_0.9.12-1.debian.tar.xz | 20.3 kB | 6ca92cc523b72e36a32df62df3834bb4 |
- Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
- Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit