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 / パッケージ / buster (oldoldstable) / ソース / misc / trinityrnaseq

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trinityrnaseq に関するリンク

Debian の資源:

• バグ報告
• Developer Information
• Debian での変更履歴
• 著作権ファイル
• Debian ソースリポジトリ (Git)
• Debian パッチ追跡システム

メンテナ:

• Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
• Michael R. Crusoe (QA ページ)

外部の資源:

• ホームページ [trinityrnaseq.github.io]

以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。

trinityrnaseq

RNA-Seq De novo Assembly

trinityrnaseq-examples

RNA-Seq De novo Assembly common example and testing files

その他の trinityrnaseq 関連パッケージ

構築依存	構築依存 (アーキテクチャ非依存)

• adep: debhelper (>= 11~)

  helper programs for debian/rules

• adep: jellyfish (>= 2.1.4)

  count k-mers in DNA sequences

• adep: libjung-free-java

  Java Universal Network/Graph Framework

• adep: javahelper

  Helper scripts for packaging Java programs

• adep: libgetopt-java

  GNU getopt - Java port

• adep: default-jdk

  Standard Java or Java compatible Development Kit

• adep: parafly

  parallel command processing using OpenMP

• adep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• adep: jaligner

  Smith-Waterman algorithm with Gotoh's improvement

• adep: libhts-dev

  development files for the HTSlib

• adep: bowtie2

  ultrafast memory-efficient short read aligner

• adep: salmon

  wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data

• adep: zlib1g-dev

  圧縮ライブラリ - 開発キット

Download trinityrnaseq

ファイル	サイズ (単位: kB)	MD5 チェックサム
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.dsc	2.2 kB	f5c516d28548277504ff47a2acba85b2
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg.orig.tar.xz	227,682.9 kB	fcd4c7f246b355da4284d7104e74dd54
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.debian.tar.xz	24.1 kB	0261c2bd1492725907b2224ed8c866f7

Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git)

https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq.git

Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能)

https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq