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パッケージ: terraphast (0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 など)

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enumerate terraces in phylogenetic tree space

Terraphast takes a .nkw file in Newick format and a genes/sites file, which denotes whether (1) or not (0) gene i is present in species j.

Program output states some imput data properties, the species whose leaf edge is used as a new tree root, and the resulting supertree in compressed newick format.

その他の terraphast 関連パッケージ

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アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 50.0 kB678.0 kB [ファイル一覧]
amd64 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 52.9 kB272.0 kB [ファイル一覧]
arm64 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3+b1 51.9 kB613.0 kB [ファイル一覧]
armel 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 46.0 kB208.0 kB [ファイル一覧]
armhf 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 46.5 kB180.0 kB [ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 52.1 kB230.0 kB [ファイル一覧]
i386 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 55.1 kB252.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 62.5 kB350.0 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 52.6 kB236.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 51.4 kB687.0 kB [ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 56.4 kB676.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 57.0 kB676.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 51.9 kB216.0 kB [ファイル一覧]
s390x 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 54.0 kB268.0 kB [ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 59.8 kB542.0 kB [ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 46.9 kB8,239.0 kB [ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版) 0.0+git20200413.8af2e4c+dfsg-3 51.9 kB240.0 kB [ファイル一覧]