パッケージ: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3) [debports]
single-pass sequencing read accuracy improver
Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.
その他の sprai 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
-
- dep: time
- GNU time - CPU リソース使用率計測プログラム
-
- sug: make
- コンパイルを制御するユーティリティ
-
- sug: pbalign
- パッケージは利用できません
-
- sug: pbgenomicconsensus
- パッケージは利用できません
-
- sug: pbh5tools
- パッケージは利用できません