パッケージ: python3-rdkit (202309.3-6) [debports]
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外部の資源:
- ホームページ [www.rdkit.org]
類似のパッケージ:
Collection of cheminformatics and machine-learning software
RDKit is a Python/C++ based cheminformatics and machine-learning software environment. Features Include:
* Chemical reaction handling and transforms * Substructure searching with SMARTS * Canonical SMILES * Molecule-molecule alignment * Large number of molecular descriptors, including topological, compositional, EState, SlogP/SMR, VSA and Feature-map vectors * Fragmentation using RECAP rules * 2D coordinate generation and depiction, including constrained depiction * 3D coordinate generation using geometry embedding * UFF and MMFF94 forcefields * Chirality support, including calculation of (R/S) stereochemistry codes * 2D pharmacophore searching * Fingerprinting, including Daylight-like, atom pairs, topological torsions, Morgan algorithm and MACCS keys * Calculation of shape similarity * Multi-molecule maximum common substructure * Machine-learning via clustering and information theory algorithms * Gasteiger-Marsili partial charge calculation
File formats RDKit supports include MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES and RDKit binary format.
その他の python3-rdkit 関連パッケージ
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- dep: fonts-freefont-ttf
- Freefont Serif, Sans, Mono Truetype フォント
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Python Library
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- dep: libboost-python1.83.0-py312
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-python1.83.0
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- dep: libboost-regex1.83.0-icu72
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.83.0
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- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- serialization library for C++
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- dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0)
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libc6 (>= 2.32)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
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- dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2)
- 2D coordinate generation for chemical compounds
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- dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)
- FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libinchi1.07 (>= 1.07.1+dfsg)
- International Chemical Identifier (InChI) algorithm (library)
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- dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1)
- parser for Schrödinger Maestro files
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- dep: libpython3.12t64 (>= 3.12.1)
- Shared Python runtime library (version 3.12)
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- dep: librdkit1t64 (>= 202309.3)
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.12~)
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
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- dep: python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: rdkit-data
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)
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- sug: rdkit-doc
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (documentation)