パッケージ: delly (1.1.8-1 など) [debports]
Structural variant discovery by read analysis
Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.
その他の delly 関連パッケージ
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- dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0)
- set of date-time libraries based on generic programming concepts
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0)
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム