パッケージ: seqtk (1.4-2 など)

[ ソース: seqtk  ]

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

その他の seqtk 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

seqtk のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.4-2	33.4 kB	152.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.4-2	33.8 kB	95.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.4-2+b1	32.2 kB	88.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.4-2	32.3 kB	91.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.4-2	32.0 kB	71.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.4-2	34.2 kB	91.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.4-2	37.3 kB	103.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.4-2	44.4 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.4-2	31.6 kB	88.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.4-2	30.8 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.4-2	32.1 kB	154.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.4-2	36.4 kB	151.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.4-2	37.2 kB	151.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.4-2+b1	34.7 kB	80.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.4-2	33.9 kB	95.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.4-2	37.0 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.4-2	30.3 kB	1,049.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.4-2	33.7 kB	91.0 kB	[ファイル一覧]