[ ソース: murasaki ]
パッケージ: murasaki-mpi (1.68.6-13 など)
murasaki-mpi に関するリンク
Debian の資源:
murasaki ソースパッケージをダウンロード:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
類似のパッケージ:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
その他の murasaki-mpi 関連パッケージ
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)