[ ソース: gmap ]
パッケージ: gmap (2024-10-20+ds-1)
gmap に関するリンク
Debian の資源:
gmap ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Shaun Jackman (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Alexandre Mestiashvili (QA ページ)
- Étienne Mollier (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [research-pub.gene.com]
類似のパッケージ:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
その他の gmap 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム